干旱是严重制约农艺生产的世界性问题，是限制农业生产最主要的非生物因素之一，是制约青稞产量的主要因素之一。近日，农学院作物遗传育种学系冯宗云教授团队完成的最新研究成果“IGenome-wide association mapping of hulless barley phenotypes in drought environment”在国际主流学术刊物《Frontiers in Plant Science》（二区TOP期刊，IF=6.627）上发表，结果对青稞抗旱育种具有重要指导作用。
本研究以269份不同基因型青稞资源为材料，利用全基因组关联分析鉴定了与抗旱性状显著关联的SNP标记。供试材料在正常及干旱胁迫条件下，调查了地上部鲜重、地上部干重、地下部鲜重、地下部干重、叶片鲜重、叶片干重、地上部（苗）失水率、地下部（根）失水率、叶片含水量、叶片相对含水量、根/芽鲜重比率、根/芽干重比率等多种数量性状及主穗长、单株粒数、单株粒重、千粒重、主穗小穗数、株高、单株有效穗数等田间表型性状。基因型分型后，共获得8936130个高度一致的SNP，这些SNP的缺失率低于50%，最小等位基因频率大于0.05。在显著耐旱性位点附近，共获得8个对青稞抗旱性有潜在贡献的候选基因。
该研究以四川农业大学为第一署名单位，博士研究生李洁为第一作者，冯宗云教授为第一通讯作者。该研究受到国家重点研发计划（2018YFD1000705、2018YFD1000700）、国家自然科学基金（32060480）、国家现代农业产业技术体系（CARS-05）、四川省国际科技合作项目（2021YFH0113）及四川农业大学双支计划基金等资助。
全文链接：
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2022.924892
图1 SNP标记在染色体上的分布
图2基于GBS鉴定到的5949446个SNPs构建的269份青稞自然群体的进化树
图3多次实验中抗旱性状关联分析的曼哈顿图和Q-Q图(FaST-LMM)
a-b )单株有效穗数（ESNP）, c )主穗数（MEN）, d )主穗长（MSL）, e )干重根冠比（RSWD）, f )千粒重（TGW）.