小麦综合研究实验室设有小麦分子遗传与基因工程育种、小麦细胞遗传与染色体工程育种、小麦族系统学与资源利用3个研究室,3个研究室下设分子生物学实验室、基因工程实验室、细胞遗传实验室、种质资源与材料创新实验室、种质资源库及标本室、品质遗传与分析实验室及育种基地7个实验室。拥有固定多年生苗圃、标本室、中期和短期基因资源库以及温江和崇州2个大田试验基地。
教学科研人员中,博士导师15人,教授或研究员15人,副研究员5人,有博士学位的教师23人,具有出国留学或国外合作研究经历的教师17人。国家杰出高级专家1人,国务院政府特殊津贴4人,国家百千万人才工程一、二层次首批人选1人,“新世纪百千万人才工程”国家级人选2人,教育部新世纪优秀人才计划4人,四川省有突出贡献的优秀专家4人,四川省学术和技术带头人4人,后备人选12人。
获省部级以上科技奖励13项,其中, 国家技术发明奖一等奖1项(小麦高产、抗锈的优良种质资源“繁六”及姊妹系,1990)、国家自然科学奖二等奖1项(小麦族种质资源研究,2000年),四川省科技进步奖一等奖3项(小麦异种属基因库的建立及物种生物系统学研究,1999年;麦类基因资源发掘与利用研究,2006年;小麦重要育种目标性状基因的鉴定与利用,2011年)。近年,培育川农16(国审)、良麦2号、良麦3号、良麦4号、蜀麦375、蜀麦482、蜀麦969、蜀麦51等小麦新品种。2篇博士学位论文分获2003和2004年度全国优秀博士学位论文(小麦特异种质资源分子生物学研究;山羊草物种高分子量麦谷蛋白基因的分子克隆),3篇博士学位论文获得2008,2009,2010年全国优秀博士学位论文提名(小麦族猬草属植物基因组组成及其分类地位研究;小麦异源六倍化过程及其在遗传育种中的应用;小麦种子蛋白及赤霉病抗性相关基因的分子鉴定)。
小麦综合研究实验室承担作物科学实验教学示范中心学生“挑战杯”、大学生创新创业训练计划、大学生科研兴趣培养计划、大学生毕业论文指导等实践任务。